作为一种避免使用合成化肥、杀虫剂及转基因生物的整体性生产管理系统，有机农业使空气、土壤和水污染降至最低，优化了植物、动物和人类相互依赖社区的健康和生产能力。

　　那有机农业具体对环境有什么好处呢?

　　许多环境变化是长期、缓慢发生的。有机农业考虑到农业干预行动对农业生态系统的中长期影响。有机农业既生产粮食，又建立生态平衡，防止出现土壤肥力问题或虫害问题。有机农业采取积极的措施，而不是在问题发生之后才加以处理。

　　有机农业的核心是土壤养护方法，如轮作、间作、共生联系、覆盖作物、有机肥料和少耕制。这些方法鼓励土壤动植物生长，改善土壤形成和结构，建立更加稳定的耕作制度。反之又增加了养分和能量循环，提高了土壤保持养分和保持水的能力，弥补了矿物肥料的空缺。

　　这样的管理技术在土壤侵蚀控制中也发挥重要作用：缩短土壤暴露于侵蚀力的时间、增加土壤生物多样性、减少养分损失、帮助保持和提高土壤生产率。作物吸收的养分通常由农场的再生资源弥补，但有时需要用外界的钾、硫、钙、镁和示踪元素补充有机土壤。

　　在许多农区，地下水受合成肥料和农药污染是一大问题。有机农业禁止使用合成肥料和农药，代之以有机肥料(如堆肥、家畜粪便、绿肥)和利用生物多样性(栽培的品种和长期植被)，改善了土壤结构和水的渗透。

　　管理良好的有机农业保持养分的能力增强，大大减少了地下水被污染的风险。在一些污染严重的地区，政府(如法国和德国政府)大力鼓励转向有机农业，认为这是一项恢复措施。

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