如果从制作方式来说的话，分为天然有机肥、有机复合肥、生物有机肥等。而生物有机肥是菌肥的一种，具有特定功能的微生物和主要以动植物残体(如畜禽粪便、农作物秸秆等)为来源，并经过无害化处理、腐熟的有机物料复合而成的。

　　它在商品生产过程中，主要是利用微生物的发酵和分解，从而能够达到充分分解、杀菌的目的。

　　通常把含有较多的有机质，来源于动植物有机体、畜禽粪便等废弃物的肥料都叫作有机肥料。但是我们在市面上买的有机肥都是已经完全腐熟过的有机肥，是一种能够改善土壤理化性状的有益微生物，无臭味，易运输的商品肥料。

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