微生物有机肥自纳入登记管理以来，产品质量得到了保障，对行业发展起到了促进作用，目前正处于良好的发展时期，但微生物有机肥的发展潜力有限还没有完全实现。未来微生物肥料产品的生产发展趋势有这些方面。

　　加强联合菌群菌株筛选与应用

　　在深入了解各自微生物特性的基础上，运用新的技术手段，将若干菌株按其用途进行适当巧妙的组合，使一种或几种性能在原有水平的基础上更上一层楼。互惠、协同、共生等，并排除相互对抗的发生。

　　改善生产条件和改进生产工艺

　　加大对生产设备和技术开发的投入，采用发酵管理规程、现代发酵工程和自动控制技术，在生产中应用保护剂和新型包装材料，确保有效稳定菌量充足，延长菌剂寿命，特别是液体。细菌的保质期。此外，在菌肥产品生产中，根据微生物的特性，将菌种进行科学合理的组合，使组合后的微生物肥料效果更好，保质期更长。

　　加强热点产品研发

　　目前热门产品主要有有机物分解剂(或发酵剂)、根瘤菌剂、生物修复剂、促生长剂、生物有机肥等。

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